Ultimo aggiornamento: 16-02-2022

In questo piccolo post, voglio mostrare una piccola analisi che ho fatto sui dati Covid della Campania, dove è stato trovato il primo caso di Omicron il 26 Novembre.

Inizio mostrardo un grafico dove metto in rapporto i tamponi effettuati (asse di sinistra) col tasso di positività, cioè la % di positivi sui tamponi effettuati (asse di destra).

Come si può vedere, negli ultimi giorni il tasso di positivà sta diminuendo (così come i tamponi effettuati) rimanendo stabile sopra il 10%, contro il 5-6% visto fino a Natale 2021. Si può anche vedere che quando c’è il minimo settimanale dei tamponi effettuati c’è anche una diminuzione della % di positività, al contrario di quello che si vedeva nelle settimane precedenti.

Dal 17/01/22 si possono vedere i due andamenti, i tamponi effettuati e la %positività, che seguono lo stesso modello: il lunedì c’è il valore massimo che man mano scende, per arrivare al minimo di domenica (ricordo che i dati pubblicati un dato giorno si riferiscono al giorno precedente).

Si può rappresentare l’andamento settimanale del tasso di positività tramite dei boxplot

Da come si può osservare, il tasso di positività nelle ultime tre settimane dell’anno passa da un valore mediano di 4.250% e di 4.740%, relativamente simile, al 6.140% nell’ultima settimana dell’anno, per poi continuare ad aumentare.

Si possono rilevare le anomalie live?

Mi sono posto questa domanda leggendo quest’intervista allo statistico Fenga, in cui parla di nowcasting, wavelet.. non vi parlerò di questi argomenti (anche perchè vorrei approfondire), però in ambito statistico, ovviamente di livello base, la prima cosa che viene in mente quando si parla di anomalie è il boxplot. Ora ho fatto un piccolo test facendo il boxplot dei dati dal 6/12/21 al 26/12/21

Quello che si ottiene è questo:

Il boxplot evidenzia subito l’anomalia del 8,54% di positività del 26/12/21 e si può notare anche da questo confrontro tra due date dove ci sono stati gli stessi tamponi effettuati, ma la % dei positivi molto differente.

Anomalia visibile anche in questo scatterplot, dove vengono mostrati i vari giorni in base al numero di tamponi effettuati e la positività. Vedono i tamponi effettuati intorno ai 20k: si passa da una % positività compresa tra il 4 e il 6(circa), al 8.54 del 26/12/2021.

Nel grafico successivo, si può notare che la %positività ha una tendenza a salire, che come si è già visto dal grafico RIF1.

La statistica del Diff7G

Vedendo l’andamento settimanale nelle ultime settimane nel grafico RIF1, ho pensato a un semplice statistica che non fa altro che considerare la differenza del tasso di positività tra un giorno e lo stesso della settimana precedente: ad esempio confronto il 9/2/22 col 2/2/22. Così da:

• Non aspettare la fine di una settimana per confrontare i boxplot dei dati settimanali
• Confrontare per i giorni della settimana: la domenica con la domenica precedente ecc…

Quello che ottengo sembra abbastanza (concedetemelo) “buono” :

Da come si può vedere negli ultimi giorni, c’è una diminuzione della positività che si può vedere anche dall’inclinazione della linea ‘Andamento7g’, oltre che dai valori di ‘Diff7G’ sempre sotto lo 0%, cioè in costante diminuzione.

Ora andiamo a usare questa semplice statistica con il Dicembre 2021:

Come si può vedere l’andamento è in salita. Diff7G dal 18/12/21 è sempre sopra lo 0%, in costante aumento: il 23/12/21 la positività 6.14% è più del doppio del 15/12/21 (che però era solo del 2.93%), mentre i giorni 26,28,29 e 30 Dicembre hanno un incremento di positività del 60% , che inizia a essere del 8% e oltre.

NB: Non so se questa semplice statistica può essere utile nell’individuare anomalie (cioè varianti più o meno diffusive). Non ho considerato i vaccinati, anche perchè l’omicron anche con la terza dose infetta anche se lievemente.